تحصیلات تکمیلي واحد فلاورجان از سال ۱۳۸۲ با هدف تربيت کارشناسان متعهد و متخصص كه بتوانند نيازهاي مراكز آموزشي و پژوهشي را برطرف نمايند شروع بكار كرد. فعاليت اين واحد در مقطع كارشناسي ارشد رشته ادبيات عرب آغاز و نظر به اهميت و جايگاه ويژه علوم پايه، در سال ۱۳۸۷ جهت كارشناسي ارشد رشته ميكروبيولوژي دانشجو پذيرفت. سپس با پذيرش دانشجوي كارشناسي ارشد در رشته هاي فيزيولوژي جانوري، بيوشيمي، فيزيولوژي گياهي، بيوفيزيك و شيمي اسانس ادامه فعاليت داد. درمهرماه سال ۱۳۹۳ پذيرش دانشجوي دكتري در دو رشته ميكروبيولوژي و بيوشيمي انجام شد. هم اكنون كارشناسي ارشد رشته فيتوشيمي مورد تصويب قرار گرفته است.
گروه تحصیلات تکمیلي داراي ۳۰ عضو هيات علمي تمام وقت و ۵ عضو هيات علمي مدعو در مرتبه استاد کامل (۴ نفر) ، دانشيار(۳ نفر) و استاديار( بيش از ۲۸ نفر) است. اين مركز علاوه بر آزمايشگاه هاي آموزشي مستقل، داراي يك آزمايشگاه تحقيقاتي متمركز شامل ميكروبيولوژي، قارچ شناسي، ملكولي، سيولوژي، بيوشيمي، شيمي اسانس، گياهي و جانوري با امكانات مجهز جهت انجام فعاليت هاي تحقيقاتي اعضا هيات علمي و دانشجويان، اتاق اينترنت، كتابخانه، سمعي بصري، آمفي تاتر، سالن و كلاس مي باشد.
